Das ist ein grundsätzliches Problem bzw. PM´s Programmeigenschaft - schon seit Generationen von Plotmaker.
Prinzipiell gilt:
Es wird alles automatisch aktualisiert, was in der ersten platzierten Datei vorhanden war (Stiftfarbe + Strichstärke etc.)
Verändert man also seine Strichstärke von Stift 1 auf Stift 2 wird dies aktualisiert. Ändert man die Strichstärke von Stift 1, wird dies nicht aktualisiert, man muss die Zeichnung neu platzieren.
Gleiches gilt für Stiftfarben -> von Stift 162 nach 255: kein Problem; Stiftfarbe 162 geändert -> neu plazieren.
Wir arbeiten bspw. mit Stift 1-7 (alle Schwarz) aber gemäß den "alten" ISO- bzw. RAPIDOGRAPHEN von 0,18-1,0 als Strichstärke.
So kann man problemlos die Strichstärke ändern, ohne gleich die Zeichnung neu platzieren zu müssen.
Da dies nun schon seit Plotmaker 1.x (ArchiCAD 4.5) so ist, muss man sich einfach dran halten, dann kann man den Plotmaker eben genau so benutzen, wie du dir das so vorstellst.