Você pode tentar mudar a exportação de geometria do tradutor para apenas BREPS ao invés da extrusão paramétrica, pois o IFC muitas vezes não tem compatibilidade com o encontro entre perfis complexos, apenas o archicad faz isso, exportando como BREP ele transforma os perfis e todos os elementos em geometria BREP, então a conexão entre os elementos será lida como geometria. O malefício desse método é a tradução automática dos elementos, por exemplo, quando você exporta uma parede com a extrusão paramétrica e abre o IFC em outro programa, ele consegue ler como "parede" e fazer a conversão para a ferramenta parede do software, o BREP a parede vai apenas como um paralelepípedo.
