Offenbar hast du die Fixierung der Gesamthöhe wieder aufgehoben. Schalt sie immer ein und lass sie (wenn möglich) so. Und fixiere auch die Auftrittbreite.
Aber wie gesagt, für die richtige Reihenfolge gibt es kein Rezept, die Logik des Stairmakers ist wohl nur den Programmierern von AC7 bekannt gewesen und inzwischen verloren gegangen. Probieren, probieren....